10x Genomics Visium将基因空间表白可视化，在鉴别分歧细胞群的同时保留空间布景，提供了关于组织微环境中细胞职能、表型和地位关系的关键信息，为基因表白和组织复杂性钻研提供了一个新视角 。
将冰冻组织切片搁置在10X Genomics Visium芯片的的捕获区域内，进行HE染色和成像后，对组织切片进行透化处置，细胞内的mRNA开释，从而被芯片上带有oligo-dT的探针捕获，并且每个探针都带有特异的地址序列，而后以mRNA为模版进行cDNA合成，构建文库后进行测序，从而可能获得基因表白的位相信息 。
Visium空间基因表白玻片信息
Visium芯片有4个捕获区域，每个区域大幼为6.5mm *6.5mm，每个spot直径为55um，蕴含数百万个用于捕获的oligo探针序列，相邻两个spot点的中心距离为100um 。探针序列的结构为：测序引物结合序列，16 nt spatial barcoded，12 nt UMI及30 nt oligo-dT序列 。
样本肇始量与送样建议
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组织类型 |
样本网络 |
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OCT包埋冰冻组织/白片/切片 |
造备 OCT包埋冰冻组织块，建议组织大幼为长×宽不超过 6.5mm×6.5mm，高度≥5mm；
白片或贴片建议筹备6-13 片（10μm 厚度） 。
封装好用干冰进行寄送 。 |
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FFPE包埋组织/白片/切片 |
石蜡包埋组织封装好后，4℃进行寄送 。
石蜡包埋白片或贴片建议筹备6-13 片（5μm 厚度），4℃进行寄送 。 |
当苦衷项：具体样本筹备指南，请联系在线客服 。
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