转录组广义上指特定细胞在某一职能状态下的所有转录产品，蕴含mRNA 和非编码RNA（ncRNA）。是衔接基因组遗传信息与生物职能的必然纽带。真核生物转录组测序基于高通量测序，可急剧获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的所有转录本的集中，用于钻研基因结构和基因职能、可变剪接和新转录本预测等。
转录组钻研可能从整体水平钻研基因职能以及基因结构，已经成为揭示生物成长发育调控和逆境胁迫适应机造、生物进化法规、疾病发生发展的沉要机造以及发现致病基因调控的关键靶点等方面的优先钻研伎俩，目前已宽泛利用于基础钻延注临床诊断和药物研发、动植物育种等各个领域。
优德88组学优势
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5.一站式解决规划：占有一站式多组学服务，助力基础钻研及临床医治。
样本肇始量与送样建议
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样本类型 |
肇始量 |
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动物及临床脏器组织/脑组织等 |
>20mg |
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动物及临床皮肤/骨/血管/脂肪组织等 |
>100mg |
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植物叶片组织/花 |
>200mg |
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植物根/茎/果实/种子 |
>500mg |
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原代细胞/细胞系 |
>5×106个 |
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中性粒细胞/嗜酸性粒细胞/嗜碱性粒细胞 |
>5×107个 |
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总RNA |
>1μg且RIN>7.0 |
当苦衷项：
① 组织样本建议保留在RNAlater、RNAHold、RNAProtect等有关组织保留液中，而后-80℃保留或干冰寄送；
② 细胞样本使用TRIzol等裂解液充分裂解之后，-80℃保留或干冰寄送；
③ 越发具体的样本筹备指南，请联系在线客服。
生物信息学分析内容 
利用场景
利用场景1：差距基因筛选与职能分析
合用领域：临床医学、基础医学、生物化学、动植物及真菌钻研等肆意方向
利用真核有参转录组测序，可通过比力尝试组和对照组基因表白量筛选差距表白的基因。而后对差距表白基因进前进一步锁定，如通过GO、KEGG富集分析及GSEA分析，共同Pubmed中已颁发的文件以及课题组中已堆集的部门明星分子对差距表白基因进行职能注解，并进一步分析关注的职能基因。进入尝试验证阶段后可对筛选到的差距基因进行qPCR、Northern、Western Blot、FISH验证、基因敲除及过表白等。
利用场景2：时序分析或浓度梯度分析
合用领域：临床样本、细胞样本、动植物样本有多个功夫段的样本，或分歧药物浓度处置的样本
在转录组数据分析过程中，有一类特殊的尝试设计。通过对分歧功夫段的尝试样本进行网络，或测试分歧的药物、试剂等浓度梯度的样本进行采集。继而钻研分歧基因在分歧功夫段或分歧浓度梯度间的表白法规，这一类分析通常称之为“时序分析”
利用场景3：转录因子/调控因子/剪切因子等上游调控基因挖掘
合用领域：临床医学、基础医学、生物化学、动植物钻研等肆意钻研方向
通例转录组差距分析极有可能得到大量的差距基因，这对后期尝试验证的指标锁定带来挑战。在没有特定感兴致的通路及明星分子前提下，转录因子是一个极度不错的切入方向。转录因子能够调节基因组DNA盛开性、召募RNA聚合酶进行转录过程、召募辅助因子调节特定的转录阶段，调控诸多性命过程，诸如免疫反映、发育模式等。所以，分析转录因子表白及其调控活性对于解析复杂性命活动拥有沉要意思。其他调节因子蕴含可变剪切等调控基因也能够参加上游调控。
利用场景4：大样本钻研
合用领域：动植物育种、遗传群体与物种发源、人群队列与生物标志物挖掘
随着测序技术的飞速发展，少量样本的转录组测序钻研已经无法诠释复杂的生物学问题。钻研者们已起头利用大样本量的转录组样本，结合统计学与机械进建等方式，知路切合特定法规和钻研主张的主题基因。如孟德尔随机化、有关性分析、线性回归、LASSO回归、Cox回归等，分析分歧样本基因或基因组多样性，挖掘更深刻和全面的生物学意思。
项目文章
【1】Liang H, et al. Siglec15 facilitates the progression of non-small cell lung cancer and is correlated with spinal metastasis. Ann Transl Med. 2022 Mar;10(6):281. PMID: 35434017.
【2】Pi Y, et al. The role of PIWI-interacting RNA in naringin pro-angiogenesis by targeting HUVECs. Chem Biol Interact. 2023 Feb 1;371:110344. PMID: 36623717.
